ATP微生物检测仪基于萤火虫发光原理，利用“萤光素酶-萤光素体系”快速检测三磷酸腺苷（ATP）。由于所有活细胞中都含有恒量的ATP，因此ATP含量可以清楚地表明样本中微生物和其他生物残留量的多少，可以用来判断健康状况。

　　ATP是保证细胞各种生命活动的能量来源，存在于细胞、细菌和食物残渣中。ATP微生物检测仪通过检测荧光信号的强度来判断被测样品被细菌、食物残渣等污染的程度，判断被测样品是否洁净的指标。仪器的原理是基于有氧条件下，萤光素酶催化萤光素与ATP发生氧化反应，形成氧化萤光素并发出荧光，其强度与微生物数量成正比，因此，在使用仪器时，会根据荧光强度来判断微生物的数量。

　　ATP微生物检测仪使用方便，只需简单培训即可操作，传统的培养方式需要在实验室操作，由受过技术培训的人员操作。而仪器的检测操作很方便，只需简单的培训即可在现场进行操作。检测速度快，检测结果只需十几秒，仪器检测结果准确，误差小。微生物的数量与微生物所含的ATP密切相关。通过检测ATP含量，可以间接获得反应中微生物的数量。